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根據細菌最佳生長所需的鹽濃度(一般以NaCl計)的不同，細菌可分為非嗜鹽菌、海洋細菌和嗜鹽細菌。
非嗜鹽菌是指在含鹽濃度不高于1%的介質中能良好生長，在普通生物法的活性污泥以及在淡水和陸地生態系統中主要含有這種細菌。
海洋細菌，也稱弱嗜鹽菌，是指適于生長在含鹽濃度為1%～ 3%的介質中。這種微生物既具有耐鹽菌]的特性，同時在高鹽環境中又能和嗜鹽菌共存。
嗜鹽細菌是指只有在含鹽的環境才能生長的微生物，在種屬上可分為嗜鹽桿菌屬、嗜鹽球菌屬、嗜鹽堿桿菌屬、小盒球菌屬等。按最適宜生長所需的鹽量，分為中度嗜鹽菌和極端嗜鹽菌。中度嗜鹽菌指在含鹽濃度為3%～ 15% 的環境中能良好生長的微生物，主要是真細菌群落。極端嗜鹽菌是指在含鹽濃度為15%～ 30% 的介質中也能良好生長的微生物，最適宜生長濃度為20%～ 25% ， 甚至在飽和濃度中也能生長。
